Le groupe de biologistes et spécialistes en vie marine de l'Aquarium se charge de maintenir dans les meilleures conditions les espèces qui l'habitent. Leur travail consiste à faire des recherches sur la reproduction des hippocampes ou des méduses jusqu'à nourrir les requins en plongeant avec eux.
L'activité fondamentale de l'Aquarium de San Sebastián se base dans l'entretien et l'exposition des aquariums à fins divulgatrices et éducatives qui encouragent le rapprochement jusqu'au milieu marin.
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